Para aumentar las limitaciones nos vamos al directorio (con permiso de sudo nautilus):
sudo gedit /etc/php5/apache2/php.ini
Una vez alli, editamos estos valores a nuestro gusto:
memory_limit
post_max_size
upload_max_filesize
Y por último, reiniciamos apache con el comando:
sudo /etc/init.d/apache2 restart
Y listo!